心中怀着新的理想告别了合众地方的同伴天桐和艾莉丝，立志成为宝可梦大师的小智带着皮卡丘来到了卡洛斯地方，在卡洛斯地方与新认识的旅行伙伴莎莉娜、希特隆、柚丽嘉三人和新的宝可梦相遇的冒险故事在寻找新的宝可梦以及新的邂逅的道路上，有更多的考验在等着他们。