第一季结尾中，侯烨、塔塔、裘莎莎和朱志摩四人，意外收到了组织的录取通知书，各自都成为了新人特工训练局的一员这一季的故事会为孩子们营造一个既神秘又神奇的“外星事务管理局”（简称BEA），这样一个历史悠久的，为了保护地球而设立的庞大机构。而侯烨等孩子们就是被这个神秘机构所选中，成为了实习小特工，见识到了各种令人尖叫的存在。孩子们随着主角侯烨的经历，体会成长的烦恼与欢乐，明白要有怎样的担当才能称为真正的成长，以及这份接踵而至的责任感。